南北五味子和南北金银花在命名上的区别在于，南北五味子是将五味子科的两种不同的植物分别称为南北五味子，而南北金银花则是将金银花科的两种不同的植物分别称为南北金银花。 关于为什么南北金银花的争议比南北五味子大，可能是因为南北金银花的分类比较复杂，而且不同地区、不同人对南北金银花的分类有不同的看法。
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南北五味子和南北金银花在命名上的主要区别在于它们所代表的植物种类不同。五味子是一种中药材，主要产于中国的北方地区，因此被称为北五味子。而金银花则是一种花卉，主要产于中国的南方地区，所以被称为南金银花。 南北金银花的争议之所以比五味子大，主要有以下几个原因： 1. 地理标识保护：金银花在中国具有重要的经济价值，部分地区将其作为地理标志产品进行保护。由于南北金银花在形态和品质上存在一定差异，一些地区认为只有本地出产的金银花才能被称为地理标志产品，从而引发了争议。 2. 市场竞争：随着市场对金银花的需求增加，一些不法商贩可能会用其他地区出产的金银花冒充地理标志产品，以获取更高的利润。这种不正当竞争行为加剧了南北金银花的争议。 3. 文化认同：金银花在中国文化中具有特殊的意义，一些地区的人们认为只有本地出产的金银花才具有正宗的文化底蕴。这种文化认同感也导致了南北金银花争议的加剧。 综上所述，南北五味子和南北金银花在命名上的差异主要体现在所代表的植物种类上，而南北金银花争议之所以比五味子大，主要是由于地理标识保护、市场竞争和文化认同等多方面原因。