在Pro配置文件中，Java脚本的常用配置主要包括以下几个方面：
1. **JDK路径配置**：指定Java Development Kit（JDK）的安装路径，以便编译器和运行时环境能够找到正确的库文件。例如：
```
java.home=/path/to/jdk
```
2. **源代码编码格式**：设置源代码文件的字符编码，通常为UTF-8。例如：
```
source.encoding=UTF-8
```
3. **编译选项**：配置编译时使用的选项，如优化级别、警告级别等。例如：
```
optimize=true
warnings=all
```
4. **类路径配置**：指定Java类库和其他依赖项的位置，以便编译器和运行时环境能够找到所需的类文件。例如：
```
classpath=.:/path/to/lib/*
```
5. **输出目录配置**：指定编译后的字节码文件存放的目录。例如：
```
output.directory=bin
```
6. **包结构配置**：指定生成的字节码文件的包结构。例如：
```
package.structure=src/main/java:bin
```
7. **主类配置**：指定应用程序的主类，即包含`public static void main(String[] args)`方法的类。例如：
```
main.class=com.example.Main
```
8. **运行参数配置**：指定运行时传递给主类的参数。例如：
```
run.arguments=-Xmx512m -Xms256m
```
这些配置可以根据实际项目的需求进行调整。在实际使用过程中，还可以根据需要添加其他配置项，以满足特定的开发需求。
