当政府补助在后期才补开发票时，企业应该按照以下步骤进行账务处理： 1. 首先，确认补助的性质和金额，确保其符合政府补助的相关政策规定。 2. 在收到补助款时，根据补助的性质将其计入相应的会计科目，如“递延收益”或“营业外收入”。 3. 如果补助款用于购买固定资产或无形资产，应在资产达到预定可使用状态时，将递延收益分期结转至损益表中的相关科目，如“固定资产折旧”或“无形资产摊销”。 4. 如果补助款用于补偿企业的费用支出，应在费用实际发生时，将递延收益一次性结转至损益表中的相关科目，如“管理费用”或“销售费用”。 5. 补开发票时，根据发票上的信息调整之前的账务处理，确保账面金额与实际发生额相符。 请注意，具体的账务处理可能因企业所在国家/地区的税收政策和会计准则而有所不同。建议在实际操作前咨询专业的会计师或税务顾问，以确保合规性。