运输石油天然气和生物质天然气的运输发票在开具过程中是有所不同的。首先，从税收角度来看，石油天然气通常属于化石燃料，其开采、运输和销售都受到严格的监管，因此运输发票的开具也会更加规范和严格。而生物质天然气作为一种可再生能源，其税收政策和监管相对较为宽松。 其次，从发票内容上来看，石油天然气运输发票会详细记录运输的数量、价格、起点和终点等信息，以便于税务部门进行监管和核算。而生物质天然气运输发票则可能只需要记录基本的运输信息，如数量、价格等。 此外，由于石油天然气和生物质天然气的性质和市场价格的差异，它们在运输过程中的成本也会有所不同，这也可能会影响到运输发票的开具。 总之，虽然石油天然气和生物质天然气都属于气体能源，但它们的运输发票在开具过程中存在一定的差异，这主要是由于它们在税收政策和市场特性上的不同所导致的。