这两种防水卷材的主要区别在于它们的厚度和材料组成。首先，从厚度上来看，3mm厚的自粘聚合物改性沥青聚酯胎防水卷材比4mm厚的SBS聚合物改性沥青防水卷材要薄。其次，在材料组成方面，自粘聚合物改性沥青聚酯胎防水卷材主要由自粘聚合物改性沥青和聚酯胎基组成，而SBS聚合物改性沥青防水卷材则是由SBS（苯乙烯-丁二烯-苯乙烯）聚合物改性沥青和聚酯胎基或玻纤胎基组成。 在性能特点上，自粘聚合物改性沥青聚酯胎防水卷材具有较好的自粘性和自愈性，施工方便，对基层要求较低，但耐候性和耐热性相对较差。而SBS聚合物改性沥青防水卷材具有良好的耐高温、耐低温、耐老化性能和抗拉强度，适用于较为复杂的防水工程，但其自粘性较差，需要配合专用胶粘剂进行施工。 最后，在适用场景方面，3mm厚的自粘聚合物改性沥青聚酯胎防水卷材更适合用于地下室、屋顶、墙面等部位的防水工程，尤其是对于基层平整度要求较高的场合。而4mm厚的SBS聚合物改性沥青防水卷材则更适用于大型建筑物的地下室、水池、隧道等对防水性能要求较高的部位。